Pētījumi Projekti Visi Projekti
Projekti

Ātrās saites

Melanomas atjaunošanās bioloģija pēc mērķētas terapijas pielietošanas pret BRAF mutāciju

 

 

Projekta nosaukums: „Melanomas atjaunošanās bioloģija pēc mērķētas terapijas pielietošanas pret BRAF mutāciju”

Projekts tiek veikts Eiropas Reģionālā attīstības fonda (ERAF) 1.1.1.1. pasākuma "Praktiskas ievirzes pētījumi" 2. kārtas ietvaros.

Projekta identifikācijas Nr.: 1.1.1.1/18/A/099

Projekta izpildes termiņš: 2019. gada 1. marts – 2022. gada 28. februāris

Projekta kopējais finansējums: 648 648,00 EUR

Projekta zinātniskais vadītājs: Dr. biol. Dace Pjanova

 

Projekta kopsavilkums:

Metastātiskā melanoma, kas rodas pēc sākotnēji veiksmīgas mērķterapijas, ir sāpīga problēma gan medicīnā, gan sabiedrībā kopumā, galvenokārt, slimnieku augstās mirstības dēļ. Šajā projektā tiks pētīta mejozes loma B-RAF mutētās melanomas rezistences attīstībā pret mērķterapiju un tās iespējamie mehānismi. Projekta hipotēze ir, ka B-RAF melanomas mutācija ektopiski aktivē mejozes cikla daļu. Tiek aktivēti mejotiskie un CTA (CTCFL-MAGE A grupas) proteīni, kas modulē Ras-Raf-MEK-ERK proliferācijas signālceļu, izraisot mejozei-līdzīgu mitotisku arestu un “mitotisko izslīdēšanu” (‘mitotic slippage’), procesā iesaistot arī audzēju supresora Hippo signālceļu un tādejādi tetraploidīju ar pārprogramēšanu. Tas savukārt, noved pie tā, ka mēŗķterapija veic rezistentas sub-populācijas izvairīšanos no G1-aresta un nāves un ļauj izdzīvot pēc depoliploidizācijas mazai šūnu proporcijai, kas veido klonus. Šis modulētais šūnas cikls, dēvēts arī par “mejomitozi”, ir maz pētīts un var radīt jaunas zināšanas un iespējas melanomas patoģenēzes pētījumos. Hipotēzes tiks pārbaudīta gan in vitro melanomas šūnu kultūrās, gan pacientu materiālā. Fundamentālā projekta mērķis ir aplūkot šo mehānismu kā koncepcijas pierādījumu, meklējot iespējamus jaunus terapeitiskos mērķus, vienlaikus piesaistot zinātnei jaunus cilvēkus un palielinot BMC zinātnisko izcilību.

Informācija publicēta 01.03.2019.

 

2019. gada 1. marts – 2019. gada 31. maijs

Projekta sākuma fāzē tika pētīta vēža triploīdijas izcelsme, izmantojot Mitelmana datubāzē pieejamās 15 ļaundabīgo un piecu labdabīgo audzēju kariotipu paraugkopas no vīriešu dzimuma pacientiem (kopā 2928 kariotipi). In silico meta-analīze parādīja, ka kariotipu heterogenitāte ar izteiktu triploīdo frakciju novērojama visos ļaundabīgo audzēju tipos. Savukārt X hromosomas disomija (visbiežāk novērojama kā XXY kariotips) pozitīvi korelēja ar triploīdiju, negatīvi korelēja ar diploīdiju un nekorelēja ar tetraploīdiju. Lai precizētu šos datus, ir iesākta in silico analīze kas balstās uz eksomu sekvenēšanas datiem.  Paralēli BMC pieejamajos primārās melanomas audos un no tiek izveidotajās primārajās melanomas šūnu līnijās tika noteikts BRAF V600 mutācijas statuss, izmantojot konvenciālo Sangera sekvenēšanu. Mutācija tika atrasta piecās primārajās melanomās un vienā izveidotajā primārās melanomas šūnu līnijā, kas bija arī trīskārši pozitīva uz melanomai specifiskiem marķieriem noteiktiem ar RT-PCR metodi.  Minētā kultūra kā klīniskais materiāls tiks izmantota turpmākajās analīzēs.

Informācija ievietota 31.05.2019.

 

 

2019. gada 1. jūnijs – 2019. gada 31. augusts

Žurnālā “Gene” (Basel)  nopublicēta meta-analīze par audzēju triploīdiju, ieskaitot melanomu. Pārbaudīta SK-MEL 28 šūnu līnijas genotoksiskā rezistence izmantojot jonizējoso apstarojumu. Noskaidrots, ka šīs šūnu līnijas rezistence ir ļoti augsta - šūnas izdzīvo un veido klonus pat pēc 30 Gy trieciena. Ar imunocitoķīmiju palīdzību pamanīta mitotiskā noslīdēšana.

Informācija ievietota 30.08.2019.

 

2019. gada 1. septembris – 2019. gada 30. novembris

Papildus meta-analīzei par vīriešu  audzēju triploīdiju XXY žurnālā “Gene” (Basel), kas izcēla veselu genomu reorganizāciju, nopublicēts raksts par to iespējamo mehānismu (When Three Isn't a Crowd: A Digyny Concept for Treatment-Resistant, Near-Triploid Human Cancers. Salmina et al., 2019; Genes (Basel). 2019 Jul 19;10(7)). SK-MEL28 melanomas šūnu līnijā uzsākti BRAF inhibitora (vemurafenib) devas un to ietekme uz rezistences attīstību un morfoloģiski atšķirīgu šūnu veidošanos pētījumi. Paralēli notiek DNS izdalīšana no formalīnā fiksētiem parafīnā ieslēgtiem melanomas audiem BRAF un NRAS mutāciju noteikšanai melanoma pacientos.

  

 

1. attēls. Konceptuāla tripoīdijas veidošanās shēma vīriešu audzējos.

Informācija ievietota 29.11.2019.

 

2019. gada 1. decembris – 2020. gada 29. februāris

Sagatavots un iesniegts raksts “Mitotic slippage and extranuclear DNA in cancer chemoresistance: a focus on telomeres” (International Journal of Molecular Sciences). Šajā rakstā mēs izvirzām hipotēzi par alternatīvu telomēru pagarināšanos, kas saistīta ar homologo hromosomu rekombināciju un invertēto mejozi. Paralēli turpinās BRAF un NRAS mutāciju noteikšana pacientu formalīnā fiksētiem parafīnā ieslēgtiem melanomas audiem.

 Informācija ievietota 28.02.2020.

 

2020. gada 1. marts – 2020. gada 31. maijs

Turpināti pētījumi par BRAF inhibitora (vemurafenib) ietekmi uz rezistences attīstību un morfoloģiski atšķirīgu šūnu veidošanos SK-MEL28 melanomas šūnu līnijā. Mitotiskās izslīdēšanas gadījumi pēc vemurafenib apstrādes SK-MEL28 šūnās tika novēroti reti. Taču tika konstatēts palielināts šūnu skaits, kas atradās šūnas cikla profāzē, norādot uz iespējamu mejotisko gēnu aktivāciju.  Raksts “Mitotic slippage and extranuclear DNA in cancer chemoresistance: a focus on telomeres” nopublicēts žurnālā “Journal of Molecular Sciences” (2020 Apr 16, Volume 21 (8): 2779; doi: 10.3390/ijms21082779). 

 Informācija ievietota 29.05.2020.

 

2020. gada 1. jūnijs – 2020. gada 31. augusts

Sagatavota, iesniegta un akceptēta grāmatas ar nosaukumu “Melanoma” nodaļa “The role of the meiotic component in reproduction of B-RAF mutated melanoma: a review and “brain storming” session”. Tajā mēs apskatām mejotiskās šūnu dalīšanās iespējamos mehānismus melanomas šūnu un melanomas dzīves cikla attīstībā ietverot gan ģenētiskos, epiģenētiskos un evolucionāros aspektus un parādām, ka B-RAF un N-RAS onkogēnu izraisītās novecošanās pārvarēšana ir saistīta ar melanomas šūnu pārprogrammēšanu, kurā nozīmīgu lomu spēlē cancer testis (CT) antigēni un mejotiskie gēni. Papildus minēto gēnu iesaiste melanomas progresijā tiek parādīta arī bioinformātiskas analīzes veidā, kurā kā blīvi savienoto olbaltumvielu mijiedarbības tīkla galvenās sastāvdaļas parādās PRAME un MAGEA grupas antigēni primārās melanomas gadījumā un SPANX grupas antigēni melanomas progresijas gadījumā, visos gadījumos esot iesaistītiem arī klasiskajiem mejotiskajiem gēniem.  Paralēli turpinās arī eksperimenti ar SK-MEL 28 melanomas šūnu līniju un B-RAF un N-RAS gēnu mutāciju analīze formalīnā fiksētajos parafīnā iestrādātajos pacientu melanomas audos.

 Informācija ievietota 31.08.2020.



Mājas lapas izstrādi finansēja ERAF 2.1.1.2. aktivitātes projekts Nr. 2010/0196/2DP/2.1.1.2.0/10/APIA/VIAA/004 "Latvijas biomedicīnas pētījumu integrācija Eiropas zinātnes telpā".